More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4485 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
312 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
307 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
329 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  43.06 
 
 
705 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8508  glycosyl transferase family 2  39.55 
 
 
309 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  0.0306024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
315 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  36.82 
 
 
907 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  36.81 
 
 
884 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
313 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
300 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
306 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
318 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
308 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
324 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
308 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
299 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
310 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
296 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
296 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
296 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
336 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
305 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
298 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
299 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
324 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  34.44 
 
 
301 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
327 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
291 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
330 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
310 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
334 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.64 
 
 
284 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
324 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
336 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
340 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
401 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  31.58 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
722 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
279 aa  89  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.9 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  29.47 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
1523 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
345 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
321 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
312 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
291 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
489 aa  86.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
340 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  33.21 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.52 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
387 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.05 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
714 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.64 
 
 
652 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.4 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>