More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1360 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
468 aa  923    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  69.46 
 
 
467 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  68.32 
 
 
467 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  64.22 
 
 
467 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 
470 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  65.38 
 
 
467 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 
467 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  63.38 
 
 
471 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  62.74 
 
 
495 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  64.87 
 
 
467 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  63.19 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  62.31 
 
 
471 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.27 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  62.63 
 
 
470 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  62.85 
 
 
470 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  62.85 
 
 
470 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  60.21 
 
 
481 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.61 
 
 
460 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  61.46 
 
 
460 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  58.97 
 
 
479 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  59.44 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  56.07 
 
 
493 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  59.61 
 
 
491 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  59.45 
 
 
495 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  60.86 
 
 
463 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  57.44 
 
 
483 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  57.76 
 
 
465 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  56.21 
 
 
471 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  56.8 
 
 
476 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  56.9 
 
 
471 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  57.11 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.78 
 
 
480 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  54.76 
 
 
468 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 
491 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.98 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  53.96 
 
 
478 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.59 
 
 
458 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 
458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.37 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
465 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
465 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  228  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 
616 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.63 
 
 
470 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
470 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
471 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
480 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
465 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 
463 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
484 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 
467 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.88 
 
 
472 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
465 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 
466 aa  223  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
473 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
470 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
473 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.66 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 
477 aa  216  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 
478 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 
492 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.68 
 
 
479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.8 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 
480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
466 aa  213  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
465 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  32 
 
 
491 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
459 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
466 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  34.29 
 
 
469 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
464 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
459 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.36 
 
 
487 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
475 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 
459 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>