More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1014 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  100 
 
 		 144 aa  290  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  85.21 
 
 		 144 aa  249  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  83.1 
 
 		 143 aa  247  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  80.99 
 
 		 144 aa  235  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  79.71 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  79.71 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  79.71 
 
 		 142 aa  229  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  80.43 
 
 		 142 aa  229  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  78.17 
 
 		 142 aa  229  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  77.08 
 
 		 144 aa  229  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  76.39 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  75 
 
 		 144 aa  224  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  74.31 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  75 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  82.39 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  72.92 
 
 		 143 aa  220  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  73.94 
 
 		 143 aa  217  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  75.36 
 
 		 143 aa  216  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  75.36 
 
 		 143 aa  214  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 143 aa  214  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  72.92 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  72.92 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  76.39 
 
 		 144 aa  210  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  71.74 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  71.74 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  71.83 
 
 		 142 aa  206  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  69.06 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  69.5 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  69.01 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  69.57 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  70.8 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  65.94 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 148 aa  187  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  184  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  64.23 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  65.94 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  60.58 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 164 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  63.04 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>