More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0327 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
554 aa  1088    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  58.79 
 
 
570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  51.1 
 
 
531 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  50.7 
 
 
528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.7 
 
 
525 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  49.71 
 
 
523 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.19 
 
 
511 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  47.69 
 
 
534 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.96 
 
 
512 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.05 
 
 
509 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.2 
 
 
545 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.71 
 
 
531 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.02 
 
 
505 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  48.36 
 
 
531 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  47.02 
 
 
524 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  45.42 
 
 
546 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.38 
 
 
505 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  47.28 
 
 
488 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.94 
 
 
508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  45.02 
 
 
512 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.02 
 
 
512 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.02 
 
 
512 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  42.47 
 
 
542 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  44.27 
 
 
538 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.16 
 
 
515 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.93 
 
 
532 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.95 
 
 
520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.6 
 
 
521 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.92 
 
 
508 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.83 
 
 
552 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  48.94 
 
 
608 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.44 
 
 
501 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.58 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 
528 aa  190  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
489 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.67 
 
 
465 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.02 
 
 
512 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.32 
 
 
505 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.58 
 
 
369 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.95 
 
 
369 aa  123  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.82 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.8 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.27 
 
 
369 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  31.54 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.31 
 
 
403 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.19 
 
 
335 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.74 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.66 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  29.44 
 
 
414 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.06 
 
 
400 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.9 
 
 
400 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
414 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 
402 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  32.33 
 
 
406 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
407 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.33 
 
 
402 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.19 
 
 
428 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.19 
 
 
428 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.4 
 
 
402 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 
403 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 
414 aa  103  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 
405 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 
405 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 
402 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.53 
 
 
200 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
445 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 
426 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.82 
 
 
420 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.49 
 
 
209 aa  101  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  36.31 
 
 
230 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 
401 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
270 aa  100  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  29.59 
 
 
229 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.79 
 
 
425 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.16 
 
 
415 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  28.16 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  32.54 
 
 
227 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  28.75 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  26.96 
 
 
437 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.58 
 
 
409 aa  98.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  37.2 
 
 
231 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.59 
 
 
231 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  25.73 
 
 
412 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.04 
 
 
207 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  30.86 
 
 
374 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.27 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.64 
 
 
453 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 
231 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  29.53 
 
 
420 aa  94.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  27.17 
 
 
427 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.23 
 
 
361 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.81 
 
 
446 aa  94  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.69 
 
 
406 aa  94  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.19 
 
 
451 aa  93.6  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.14 
 
 
199 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  27.02 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  27.46 
 
 
437 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.07 
 
 
418 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.07 
 
 
418 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>