273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_14971 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  96.98 
 
 		 464 aa  866    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  100 
 
 		 464 aa  941    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  53.55 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  49.68 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  52.79 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  51.29 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  42.98 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  44.42 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  43.63 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  43.63 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.19 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.96 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  34.01 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.98 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.07 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  28.19 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.29 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  30.18 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.31 
 
 		 485 aa  187  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.05 
 
 		 487 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.92 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  27.19 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.49 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  26.79 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.16 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  26.97 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  26.79 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  26.74 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  26.97 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  26.97 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  26.56 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  26.79 
 
 		 536 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  26.74 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.47 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.23 
 
 		 490 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.94 
 
 		 509 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.55 
 
 		 508 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.68 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.36 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.14 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.58 
 
 		 493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.02 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.98 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.2 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.65 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  29.2 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  29.2 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.2 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  29.57 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.07 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.21 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  29.2 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  28.97 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.35 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.41 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.67 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.09 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  29.18 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.67 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.69 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.48 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.93 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  30.24 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.94 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.52 
 
 		 501 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  31.54 
 
 		 542 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.6 
 
 		 485 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.67 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.5 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  24.89 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.81 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  27.58 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.34 
 
 		 487 aa  134  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.86 
 
 		 484 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.5 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.5 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.5 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.05 
 
 		 479 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  27.7 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.03 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.1 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.1 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.98 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  27.19 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.93 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.32 
 
 		 498 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.23 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.78 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  23.49 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  24.18 
 
 		 476 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  22.65 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2415  ornithine decarboxylase  23.31 
 
 		 764 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3498  lysine decarboxylase  22.79 
 
 		 772 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3257  lysine decarboxylase  21.93 
 
 		 793 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2020  lysine decarboxylase  23.35 
 
 		 777 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.605875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0689  ornithine decarboxylase  23.34 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2126  lysine decarboxylase  23.12 
 
 		 762 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1088  Lysine decarboxylase  22.94 
 
 		 753 aa  80.1  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2754  ornithine decarboxylase  23.11 
 
 		 754 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2106  ornithine decarboxylase  24.14 
 
 		 747 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.543581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>