33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5925 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2334  hypothetical protein  68.78 
 
 		 634 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 997 aa  2028    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  29.63 
 
 		 815 aa  214  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0246  hypothetical protein  29.88 
 
 		 650 aa  155  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  29.74 
 
 		 885 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  29.05 
 
 		 3378 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  37.58 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.37 
 
 		 2305 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  32.46 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.68 
 
 		 880 aa  67  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.92 
 
 		 2816 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  29.13 
 
 		 906 aa  67  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  47.22 
 
 		 601 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1058 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1046 aa  65.1  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  39.34 
 
 		 910 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  27.91 
 
 		 898 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  32.68 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  37 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  27.73 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1039 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  43.55 
 
 		 1867 aa  52  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05500  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 393 aa  51.2  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.744408  normal  0.515124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  35.56 
 
 		 2542 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.17 
 
 		 1063 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.03 
 
 		 2114 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.16 
 
 		 4978 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27.86 
 
 		 2310 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 777 aa  47.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  27.59 
 
 		 565 aa  47  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  33.04 
 
 		 892 aa  45.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.06 
 
 		 1597 aa  45.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.68 
 
 		 497 aa  44.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>