36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3501 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  100 
 
 		 166 aa  321  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  80.24 
 
 		 172 aa  244  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  68.26 
 
 		 168 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  67.66 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  67.66 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  43.59 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  41.77 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  40.99 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  42.74 
 
 		 178 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  40.69 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  43.87 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  37.1 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  34.94 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  32.76 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  42.86 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  35.94 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  33.1 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  43.51 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  28.31 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  27.33 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  25.45 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.8 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.99 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.08 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  27.22 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.71 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.14 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.11 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  28.71 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.17 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  29.03 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  29.31 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  23.53 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  26.62 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>