More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2027 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0816341  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.9 
 
 
255 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.71 
 
 
252 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175466  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.71 
 
 
252 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.71 
 
 
252 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 
252 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.04 
 
 
259 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  hitchhiker  0.0000000000642548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
251 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.718572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
250 aa  234  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 
252 aa  234  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
259 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0841499  normal  0.0258312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
250 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1700  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  48.02 
 
 
251 aa  231  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00353062  normal  0.0357096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2534  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II oxidoreductase protein  50 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
252 aa  231  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
252 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
252 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0151424  hitchhiker  0.0000559523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 
252 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
259 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0024657  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
252 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1279  short chain dehydrogenase  48.83 
 
 
252 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
253 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530107  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0454791  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
250 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
250 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
250 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0762  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  48.84 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750513  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4554  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
251 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.64 
 
 
254 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.767039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
254 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.25 
 
 
254 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
252 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
252 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
252 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
256 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
252 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
254 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
253 aa  222  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0912  3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase  46.25 
 
 
254 aa  221  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0997  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  45.74 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000114329  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2489  putative short-chain dehydrogenase  47.84 
 
 
252 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
255 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00629853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
256 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00690  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.83 
 
 
252 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4382  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0363369  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00832519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2720  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  44.75 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0967  hypothetical protein  45.24 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0937  hypothetical protein  45.24 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11167  short-chain type dehydrogenase/reductase  46.3 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01666  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0141372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2682  putative short-chain dehydrogenase  44.75 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31510  putative short-chain dehydrogenase  45.14 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.089471  hitchhiker  0.000038143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.580386  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.799292  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7117  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
255 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
255 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
259 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
259 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0482872  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
254 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.153501  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815541 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
252 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
273 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0923  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.45 
 
 
319 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.732955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
255 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.153171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
255 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0605669  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
252 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0275  putative short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
257 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.599056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
261 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361004  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
254 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0244002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
254 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136015  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0738  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  47.84 
 
 
252 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0926  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.45 
 
 
319 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.45 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0380  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1079  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2515  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.45 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
254 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7091  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  48.44 
 
 
254 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
255 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339033  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
255 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
253 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
267 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
253 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
255 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.228171  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
279 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
255 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809433  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
255 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5880  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
252 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
252 aa  205  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>