More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1152 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  53.05 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  52.34 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  48.4 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  44.69 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  48.61 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  44.89 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  45.13 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  46.82 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  44.44 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  45.98 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  47.83 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  48.67 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  47.35 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  47.77 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  45.59 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  37.1 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  38.86 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  38.81 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  37.16 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.87 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  35 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  33.04 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  33.48 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  36.2 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  35.75 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  31.11 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  26.22 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  30.8 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  32.92 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  32.51 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  30.38 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  33 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  28.33 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  29 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  31.67 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  29.29 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  32.69 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  32.59 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  32.35 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  32.42 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  32.42 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  32.21 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  31.69 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  28.99 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  28.75 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  31.02 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  32.38 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  29.34 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  30.42 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  30.29 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  34.67 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  27.5 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  28.51 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  32.31 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  28.22 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  31.28 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  31.28 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  29.71 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  30.59 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  31.69 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  26.97 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  28.87 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  28.99 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  30.17 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  34.17 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  31.97 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  29.29 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  32.84 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  30.86 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  32.35 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  30.86 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  33.71 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  32.51 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  32.51 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  33.67 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  31.8 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  29.7 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  27.08 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.51 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  30.91 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  31.5 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  30.45 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  32.19 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  28.99 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  31.25 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  31.54 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  33.15 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  31.97 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  30.71 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  33.33 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  29.29 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>