More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0665 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  68.64 
 
 		 250 aa  334  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  57.98 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  54.08 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  53.33 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  56.12 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  56.12 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  55.7 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  52.77 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  52.34 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  53.19 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  53.09 
 
 		 245 aa  251  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  56.96 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  53.1 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  51.06 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  54.7 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  52.14 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  51.69 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  51.53 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  48.9 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  49.15 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  48.07 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  49.36 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  47.6 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  47.35 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  45.89 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  44.64 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  46.78 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  47.16 
 
 		 243 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  48.18 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  43.72 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  42.74 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  42.17 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  41.28 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  40.68 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  39.11 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  37.13 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  36.17 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  35.56 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.91 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  33.91 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  35.15 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  35.15 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  38.56 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  35.83 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  34.58 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 		 228 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  35 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  32.76 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  34.82 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  36.4 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 		 222 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  36.68 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  34.92 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  33.92 
 
 		 210 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  30.26 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  33.48 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  32.59 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  32.38 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  27.23 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  32.2 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  32.2 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  31.72 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  27.23 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  32.34 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  30.58 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  30.97 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  32.77 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  31.93 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  29.01 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  28.1 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  29.67 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>