251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2178 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.91 
 
 		 386 aa  647    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 381 aa  786    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 377 aa  368  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  46.67 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  336  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  46.21 
 
 		 405 aa  324  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  42.23 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  38.83 
 
 		 641 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 537 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 542 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 534 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 418 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  26.94 
 
 		 570 aa  99.4  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  28.39 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  25.55 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.1 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  25.83 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.07 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  28.62 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.41 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.67 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.58 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.22 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.97 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.1 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  24.69 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  26.3 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.71 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  23.01 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.33 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.71 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  25.32 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.9 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>