266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0199 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0199  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  100 
 
 
467 aa  950    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0344059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0967  cobyric acid synthase CobQ  58.53 
 
 
465 aa  550  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0251  cobyric acid synthase CobQ  40.33 
 
 
483 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.234287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  35.66 
 
 
515 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  37.04 
 
 
494 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  33.74 
 
 
503 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  35.99 
 
 
797 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  34.48 
 
 
506 aa  259  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  35.97 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  33.74 
 
 
503 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  36.36 
 
 
509 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  34.99 
 
 
514 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  36.77 
 
 
517 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  36.46 
 
 
787 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  38.9 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  36.89 
 
 
500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  34.06 
 
 
492 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  35.7 
 
 
495 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  34.44 
 
 
498 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  33.27 
 
 
506 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  34.62 
 
 
509 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  33.53 
 
 
513 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  35.28 
 
 
532 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  38.06 
 
 
495 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  33.07 
 
 
513 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  36.34 
 
 
484 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  34.24 
 
 
495 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  36.61 
 
 
491 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  33.47 
 
 
506 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  36.62 
 
 
491 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  35.77 
 
 
511 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  33.47 
 
 
506 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  34.15 
 
 
485 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  34.62 
 
 
490 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  32.87 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  36.27 
 
 
484 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  31.67 
 
 
485 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  33.27 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  33.11 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  35.58 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  35.16 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  34.95 
 
 
495 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  33.73 
 
 
514 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  34.09 
 
 
777 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  31.24 
 
 
475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  37 
 
 
494 aa  233  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  36.57 
 
 
495 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  36.57 
 
 
495 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  34.44 
 
 
490 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  34.32 
 
 
493 aa  232  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  36.02 
 
 
502 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  34.99 
 
 
511 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  34.55 
 
 
487 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  33.73 
 
 
514 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  32.07 
 
 
518 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  34.89 
 
 
489 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  35.83 
 
 
490 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  33.74 
 
 
491 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  35.07 
 
 
509 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  33.2 
 
 
534 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  32.35 
 
 
517 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  35.86 
 
 
488 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  33.7 
 
 
506 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  34.68 
 
 
521 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  35.27 
 
 
507 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  35.01 
 
 
585 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  35.01 
 
 
535 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  35.6 
 
 
490 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  34.37 
 
 
494 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  33.75 
 
 
491 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  34.78 
 
 
545 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  32.61 
 
 
508 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  31.77 
 
 
852 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  32.43 
 
 
536 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  35.16 
 
 
484 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  34.78 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  35.84 
 
 
511 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  35.84 
 
 
511 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  34.78 
 
 
529 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  34.78 
 
 
531 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  34.78 
 
 
523 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  33.12 
 
 
490 aa  226  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  35.46 
 
 
484 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  31.74 
 
 
534 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  37 
 
 
512 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  33.67 
 
 
487 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  34.29 
 
 
510 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  35.73 
 
 
484 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  35.33 
 
 
772 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  35.89 
 
 
498 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  35.27 
 
 
495 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  33.54 
 
 
490 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  34.82 
 
 
501 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  33.64 
 
 
483 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  31.73 
 
 
560 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  31.74 
 
 
526 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  35.55 
 
 
486 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  30.49 
 
 
565 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  33.72 
 
 
489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  34.29 
 
 
511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>