258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1307 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1307  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
121 aa  247  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1327  holo-acyl-carrier-protein synthase  65.55 
 
 
124 aa  164  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122179  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1927  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.6 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.125964  normal  0.348533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
125 aa  84  7e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  39.84 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.8 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.13 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.15 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  35.77 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.19 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.43 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  37.5 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  41.13 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0183  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.48 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1318  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.67 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.96 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.9 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3109  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  32.26 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.016377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.6 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.87 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.51 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.61 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.88 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.94 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.85 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1740  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.11 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.1 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.19 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.92 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.9 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1943  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577791  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  35.04 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1018  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.1 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.68 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.5 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.75 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.61 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  29.92 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.5 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.6 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.46 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4250  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2414  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.63 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.28 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.46 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.46 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.46 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>