More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0966 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 136 aa  284  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  80.17 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  80.17 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  52.46 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  49.11 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  49.11 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 135 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  46.96 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  44.63 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  44.64 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  48.65 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  46.09 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.86 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 176 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  44.14 
 
 		 263 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  45.05 
 
 		 260 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3269  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 265 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  40.95 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.34 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  37.61 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  37.61 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  34.88 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  35.43 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  35.54 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.04 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.91 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  36.44 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  44.74 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  36.44 
 
 		 188 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  39.25 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  33.61 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  37.27 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  33.04 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  37.17 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  35.29 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  35.94 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  36.45 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>