More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6073 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6073  nickel transporter ATP-binding protein NikD  100 
 
 		 260 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2274  nickel transporter ATP-binding protein NikD  59.76 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0974344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4819  nickel transporter ATP-binding protein NikD  56.36 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0236  nickel import ATP-binding protein NikD  56.36 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3842  nickel transporter ATP-binding protein NikD  56.36 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03328  nickel transporter subunit  55.93 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3963  nickel transporter ATP-binding protein NikD  55.93 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0237  nickel transporter ATP-binding protein NikD  55.93 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3763  nickel transporter ATP-binding protein NikD  55.93 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03281  hypothetical protein  55.93 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3678  nickel transporter ATP-binding protein NikD  55.51 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1837  nickel transporter ATP-binding protein NikD  54.72 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432894  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3008  nickel transporter ATP-binding protein NikD  52.55 
 
 		 256 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.281853  normal  0.843842 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1324  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  50 
 
 		 517 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000609088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3345  nickel transporter ATP-binding protein NikD  54.51 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7617  nickel transporter ATP-binding protein NikD  49.22 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0801  nickel transporter ATP-binding protein NikD  50 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.789895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2399  ABC transporter related  51.89 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  38.58 
 
 		 577 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  43.8 
 
 		 569 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.31 
 
 		 610 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  43.8 
 
 		 538 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  43.77 
 
 		 557 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  43.77 
 
 		 557 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  41.88 
 
 		 549 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  48.91 
 
 		 540 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.52 
 
 		 658 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6178  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19570  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  43.55 
 
 		 332 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.487374  normal  0.0690527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  40.48 
 
 		 547 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.73 
 
 		 612 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  38.93 
 
 		 522 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  43.97 
 
 		 546 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  40.93 
 
 		 542 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4338  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.64 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  40.94 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3600  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.7 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  43.56 
 
 		 619 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  42.86 
 
 		 533 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0888  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 		 331 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0388  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0983  ABC transporter related  35.04 
 
 		 260 aa  175  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0278331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  41.73 
 
 		 530 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.52 
 
 		 611 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  41.02 
 
 		 541 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  40.93 
 
 		 545 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 548 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  43.89 
 
 		 540 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.46 
 
 		 590 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1529  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  42.35 
 
 		 557 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1009  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  42.58 
 
 		 552 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D21  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  38.08 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 564 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  38.93 
 
 		 631 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  39.69 
 
 		 542 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 529 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  42.16 
 
 		 613 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 		 615 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  43.31 
 
 		 545 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  44.72 
 
 		 534 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  44.27 
 
 		 547 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  38.52 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0575339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39 
 
 		 617 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1664  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0951  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0866  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 529 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4761  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  42.54 
 
 		 613 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0348  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 		 331 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.57 
 
 		 615 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  39 
 
 		 529 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  39 
 
 		 529 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  39 
 
 		 529 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  40.23 
 
 		 542 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 529 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.53 
 
 		 611 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  42.19 
 
 		 552 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 539 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.92 
 
 		 695 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0422  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0437  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  39 
 
 		 529 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1598  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  45.49 
 
 		 585 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2766  ABC transporter related  45.21 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 		 530 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  41.31 
 
 		 537 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.37 
 
 		 671 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 		 342 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.98 
 
 		 611 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>