127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5182 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  100 
 
 
127 aa  254  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  85.34 
 
 
123 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  85.22 
 
 
128 aa  189  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.73 
 
 
212 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  58.73 
 
 
492 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  57.14 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  49.59 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  50.43 
 
 
314 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  50.43 
 
 
314 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  59.13 
 
 
320 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  50.43 
 
 
120 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  48.78 
 
 
128 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.31 
 
 
315 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  47.97 
 
 
128 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  49.57 
 
 
315 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  49.57 
 
 
315 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  49.57 
 
 
315 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  49.57 
 
 
315 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  49.57 
 
 
315 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  46.96 
 
 
315 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  45.76 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  45.76 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  45.76 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  45.76 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  40.87 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  39.06 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  40.15 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  36.21 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  37.9 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  36.75 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4538  ISSpo6, transposase orf A  36.75 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.5 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  37.82 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  37.82 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  37.82 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  37.82 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  37.61 
 
 
314 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  36.44 
 
 
317 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  36.44 
 
 
317 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  37.07 
 
 
315 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  37.07 
 
 
315 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.13 
 
 
314 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  37.61 
 
 
318 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  37.61 
 
 
318 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  36.52 
 
 
318 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  36.11 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  36.84 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  36.75 
 
 
319 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4163  putative insertion sequence transposase protein  37.5 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0146  transposase  34.51 
 
 
318 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  35.04 
 
 
315 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  35.04 
 
 
315 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  31.3 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  31.3 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  31.82 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0324  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0386  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0657  transposase  31.3 
 
 
110 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0701  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0861  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.838281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0877  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0957  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.336246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1290  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1793  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.632069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2051  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.605111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2874  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3024  transposase  31.3 
 
 
111 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.234272  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.3 
 
 
136 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  32.14 
 
 
108 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9615  Transposase  31.93 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1041  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3967  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.34 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2247  hypothetical protein  34.71 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.70374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3399  ISSpo6  34.71 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3761  ISSpo6, transposase orf A  34.71 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4037  ISSpo6, transposase orf A  34.71 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  30.17 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  30.17 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  30.17 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  30.17 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  30.17 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  30.17 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  30.17 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>