100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9615 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9615  Transposase  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  64.8 
 
 		 317 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  64.8 
 
 		 317 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  64.29 
 
 		 318 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  64.29 
 
 		 318 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4538  ISSpo6, transposase orf A  65.22 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  65.22 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4037  ISSpo6, transposase orf A  53.91 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3761  ISSpo6, transposase orf A  53.91 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3399  ISSpo6  53.91 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2247  hypothetical protein  53.91 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.70374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  36.51 
 
 		 314 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  38.14 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  38.14 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  38.14 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  37.29 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  36.22 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  36.22 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  38.39 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  38.39 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  38.39 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  38.39 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  38.39 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  33.33 
 
 		 120 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.39 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.09 
 
 		 318 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  34.15 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  35.96 
 
 		 319 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  36.21 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  37.4 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  36.29 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  36.29 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  34.48 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  34.96 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  34.96 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  34.96 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  34.96 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  34.82 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.85 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  36.29 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  31.93 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.89 
 
 		 315 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  35.96 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  31.86 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0146  transposase  34.4 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  28.57 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  29.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2310  regulatory protein MerR  44.44 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  32.17 
 
 		 315 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  32.77 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  34.78 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  30.97 
 
 		 314 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  30.97 
 
 		 314 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.3 
 
 		 212 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  32.77 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  31.67 
 
 		 492 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  31.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>