127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5240 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  100 
 
 
128 aa  249  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  78.12 
 
 
128 aa  195  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  73.04 
 
 
315 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  61.86 
 
 
120 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  52.42 
 
 
127 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  53.39 
 
 
127 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.42 
 
 
212 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  52.42 
 
 
492 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  54.78 
 
 
315 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  54.78 
 
 
315 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  54.78 
 
 
315 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  54.78 
 
 
315 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  54.78 
 
 
315 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  50.78 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  52.99 
 
 
123 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  49.59 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  53.04 
 
 
128 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  56.52 
 
 
315 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  56.52 
 
 
315 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  56.52 
 
 
315 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  56.52 
 
 
315 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  51.3 
 
 
314 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  51.3 
 
 
314 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  49.19 
 
 
127 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.74 
 
 
126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  43.7 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.22 
 
 
320 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  35.04 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  37.8 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  37.8 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  41.41 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  41.41 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  41.41 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  41.41 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  37.93 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  37.61 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  37.93 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  40.52 
 
 
319 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  36.72 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  38.14 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.38 
 
 
314 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  42.86 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  40.95 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  38.71 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  39.66 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.54 
 
 
262 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  35.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3184  hypothetical protein  43.53 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  38.46 
 
 
319 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4163  putative insertion sequence transposase protein  38.71 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  38.74 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  38.74 
 
 
111 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3967  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.44 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  37.07 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  32.52 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  32.52 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9615  Transposase  36.21 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1041  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  33.04 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>