47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1330 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1330  transposase  100 
 
 
108 aa  220  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  60.44 
 
 
282 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  60.44 
 
 
282 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  60.44 
 
 
282 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  60.44 
 
 
282 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  60.44 
 
 
282 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  60.44 
 
 
282 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  50 
 
 
97 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  50.52 
 
 
98 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  50 
 
 
103 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  45 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  57.97 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  55.71 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  45.1 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  45.45 
 
 
111 aa  87.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2874  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3024  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.234272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2051  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.605111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1793  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.632069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0324  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0386  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1290  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0957  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.336246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0877  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0861  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.838281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0701  transposase  44.12 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0657  transposase  44.12 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  47.83 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  57.41 
 
 
54 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  47.54 
 
 
61 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  57.14 
 
 
50 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1709  putative transposase  33.64 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0632  putative transposase  32.71 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209165  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0931  putative transposase  36 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305182  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  52.08 
 
 
48 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1398  putative transposase  35.78 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.14503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2102  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  36.19 
 
 
280 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0146  transposase  28.57 
 
 
318 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  48.65 
 
 
37 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0073  putative transposase  26.85 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  32.14 
 
 
127 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  32.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9615  Transposase  29.51 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  33.62 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  29.91 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  29.91 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>