14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4683 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  100 
 
 
54 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  77.78 
 
 
97 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  81.82 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  57.41 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  91.67 
 
 
39 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  57.78 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  57.78 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  57.78 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  57.78 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  57.78 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  57.78 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  92.31 
 
 
50 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  81.48 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  80.77 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>