18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4850 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  100 
 
 
50 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  79.59 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  77.55 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  79.59 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  73.47 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  77.55 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  76.19 
 
 
61 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  57.14 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3947  hypothetical protein  69.23 
 
 
49 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.936917  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  46.94 
 
 
282 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  46.94 
 
 
282 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  46.94 
 
 
282 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  46.94 
 
 
282 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  46.94 
 
 
282 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  46.94 
 
 
282 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  92.31 
 
 
54 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  67.86 
 
 
48 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  92 
 
 
39 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>