18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4164 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4164  transposase  100 
 
 
69 aa  141  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  80.88 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  75.36 
 
 
69 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  75.36 
 
 
77 aa  106  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  72.46 
 
 
97 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  78.69 
 
 
61 aa  94.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  77.55 
 
 
50 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  47.83 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  66.67 
 
 
48 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  42.03 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  42.03 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  42.03 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  42.03 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  42.03 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  42.03 
 
 
282 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  75.68 
 
 
37 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  37.68 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  34.78 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>