33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1420 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  100 
 
 
48 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  81.25 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  77.08 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  72.92 
 
 
61 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  75 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  70.83 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  66.67 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  78.38 
 
 
37 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  52.08 
 
 
108 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  44.68 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  44.68 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  44.68 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  44.68 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  44.68 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  44.68 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  51.28 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3024  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.234272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2874  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2051  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.605111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1793  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.632069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1290  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0957  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.336246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0877  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0861  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.838281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0701  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0657  transposase  48.84 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0386  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0324  transposase  48.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  67.86 
 
 
50 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  50 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  37.78 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0632  putative transposase  38.78 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209165  normal  0.162926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>