58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0657 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0324  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0386  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0657  transposase  100 
 
 
110 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0701  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0861  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.838281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0877  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0957  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.336246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1290  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3024  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.234272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2874  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2051  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.605111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1793  transposase  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.632069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  99.09 
 
 
111 aa  225  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  99.08 
 
 
111 aa  223  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  44.12 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  44.12 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  42.11 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  42.11 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  42.11 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  42.11 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  42.11 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  42.11 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  42.16 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  37.76 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  38 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0146  transposase  39.47 
 
 
318 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  42.65 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  41.18 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1398  putative transposase  33.04 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.14503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  33.06 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.86 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  37.84 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  48.84 
 
 
48 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  34.21 
 
 
315 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  34.21 
 
 
315 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  34.21 
 
 
315 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  34.21 
 
 
315 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  34.21 
 
 
315 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  41.27 
 
 
61 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  34.48 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  31.3 
 
 
127 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  34.55 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  31.78 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  31.78 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  31.78 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  31.78 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1694  putative transposase  32.71 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0919099  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.9 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  48.65 
 
 
37 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0931  putative transposase  27.45 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305182  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0632  putative transposase  29.73 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209165  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  28.83 
 
 
292 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>