34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1398 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1398  putative transposase  100 
 
 
119 aa  243  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.14503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0073  putative transposase  51.67 
 
 
126 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0632  putative transposase  42.59 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209165  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1709  putative transposase  42.15 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  41.07 
 
 
280 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0931  putative transposase  41.18 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305182  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2102  transposase and inactivated derivatives  39.05 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0048  transposase  37.23 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.169923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0070  transposase  33.93 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  35.78 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  32.63 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  32.98 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2051  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.605111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  37.5 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3024  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.234272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2874  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1793  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.632069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1290  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0957  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.336246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0877  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0861  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.838281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0701  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0657  transposase  33.04 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0386  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0324  transposase  33.04 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  30.69 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  35.71 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  27.17 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  27.17 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  27.17 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  27.17 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  27.17 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  27.17 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  28.26 
 
 
103 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>