21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2102 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2102  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1709  putative transposase  50.94 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0632  putative transposase  49.53 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209165  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0931  putative transposase  49.49 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305182  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  47.17 
 
 		 280 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1398  putative transposase  39.05 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.14503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  36 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  33.33 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  32 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  32.98 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0073  putative transposase  29.63 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  29.46 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  33.78 
 
 		 77 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  26 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0146  transposase  27.19 
 
 		 318 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>