22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2310 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2310  regulatory protein MerR  100 
 
 		 302 aa  620  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3338  hypothetical protein  56.25 
 
 		 182 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2393  hypothetical protein  51.69 
 
 		 182 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0130  Phage DNA packaging protein Nu1 subunit of terminase-like protein  49.66 
 
 		 163 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1778  Phage DNA packaging protein Nu1 subunit of terminase-like protein  50.6 
 
 		 173 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000000435209  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0801  Fis family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.651024  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4688  hypothetical protein  32.52 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00517  hypothetical protein  26.78 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00511  DNA packaging protein  26.78 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1619  phage DNA packaging protein Nu1  25.9 
 
 		 181 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2985  hypothetical protein  36.73 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0831  phage DNA packaging protein Nu1  25.9 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.216223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2097  DNA packaging Nu1  25.9 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2090  DNA packaging Nu1  25.9 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.122712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1202  hypothetical protein  30.41 
 
 		 183 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.888327  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1878  hypothetical protein  26.45 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1281  phage DNA packaging protein Nu1  25.9 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.463703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1782  terminase small subunit  25.9 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0266551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10035  DNA packaging protein  25.9 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.155137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3069  DNA packaging Nu1  25.3 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.584975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1107  hypothetical protein  24.86 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9615  Transposase  44.44 
 
 		 149 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>