112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4014 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  100 
 
 
125 aa  259  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  100 
 
 
125 aa  259  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  100 
 
 
125 aa  259  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  99.2 
 
 
125 aa  256  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  54.7 
 
 
318 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  46.02 
 
 
319 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  43.59 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  43.59 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  44.26 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  42.52 
 
 
315 aa  77.4  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  42.52 
 
 
315 aa  77.4  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  36.51 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  40.32 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  37.61 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  41.41 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.32 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  40.32 
 
 
492 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  40.52 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  38.26 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  39.52 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.07 
 
 
320 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  36.51 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  40.34 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  40.34 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  40.68 
 
 
314 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  36.44 
 
 
314 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  36.44 
 
 
314 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2247  hypothetical protein  38.79 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.70374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3399  ISSpo6  38.79 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3761  ISSpo6, transposase orf A  38.79 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4037  ISSpo6, transposase orf A  38.79 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  38.98 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  47.66 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.14 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  34.78 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.02 
 
 
315 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  38.6 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9615  Transposase  38.14 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  33.05 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  37.82 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  37.7 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4538  ISSpo6, transposase orf A  37.7 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  35.65 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  37.6 
 
 
123 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.9 
 
 
318 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
262 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  38.33 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  38.14 
 
 
318 aa  57.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4163  putative insertion sequence transposase protein  35.65 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  38.14 
 
 
318 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  35 
 
 
319 aa  57  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  36 
 
 
317 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  39.34 
 
 
315 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  36 
 
 
317 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  39.34 
 
 
315 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  39.34 
 
 
315 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  39.34 
 
 
315 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  39.34 
 
 
315 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  33.33 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>