60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3967 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3967  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  100 
 
 		 85 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  43.66 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  46.58 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  46.58 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  41.89 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.83 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  45.59 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  43.33 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  43.33 
 
 		 314 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  43.33 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  43.84 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  44.44 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  45.21 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  36.99 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  39.68 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  40.98 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.73 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  40.98 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  35.44 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  38.57 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  36.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  36.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  36.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  36.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  38.03 
 
 		 318 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  39.34 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1694  putative transposase  36.07 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0919099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  41.67 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  41.67 
 
 		 314 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  31.88 
 
 		 292 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.14 
 
 		 314 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  45.1 
 
 		 315 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4163  putative insertion sequence transposase protein  37.14 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  31.88 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  31.88 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  31.88 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5856  transposase, putative  31.88 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>