115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4163 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4163  putative insertion sequence transposase protein  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  92.8 
 
 		 126 aa  230  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  80.95 
 
 		 135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.61 
 
 		 314 aa  185  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  48.82 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  47.15 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  45.28 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  45 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  45.24 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  43.22 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  43.22 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  38.98 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.03 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  43.7 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  45.3 
 
 		 315 aa  73.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  41.13 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  37.39 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  37.39 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  37.39 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  37.39 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.17 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  39.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  38.71 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  37.5 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  39.32 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  39.32 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  39.32 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  42.68 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  35.59 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  35.59 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  35.9 
 
 		 314 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  40.35 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  38.74 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.4 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  36.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  35.25 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.62 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  33.62 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.48 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  27.59 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  38.4 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.83 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1866  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  51.72 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0142  hypothetical protein  33.62 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0347  hypothetical protein  33.62 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100555  hitchhiker  0.00295944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0411  hypothetical protein  33.62 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000404723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1239  hypothetical protein  33.62 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0187368  normal  0.565368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3635  hypothetical protein  33.62 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.046317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4035  hypothetical protein  33.62 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  35.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3967  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  38.57 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>