122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4172 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  100 
 
 		 120 aa  236  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  62.07 
 
 		 315 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  61.86 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  61.02 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  51.26 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  52.54 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.54 
 
 		 212 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  52.54 
 
 		 492 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  50.86 
 
 		 314 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  50.86 
 
 		 314 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  50 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  50.43 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  50.43 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  53.85 
 
 		 315 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  53.85 
 
 		 315 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  53.85 
 
 		 315 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  53.85 
 
 		 315 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  47.5 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  49.14 
 
 		 315 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  49.14 
 
 		 315 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  49.14 
 
 		 315 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  49.14 
 
 		 315 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  49.14 
 
 		 315 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  47.83 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  47.83 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  47.06 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.7 
 
 		 320 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  46.53 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  44.9 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  40.83 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  37.29 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  38.14 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.46 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  37.61 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  37.93 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  37.61 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  37.61 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  36.67 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  35.9 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  36.21 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  35.9 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  36.75 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  35.04 
 
 		 315 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  35.04 
 
 		 315 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  33.62 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  33.33 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4163  putative insertion sequence transposase protein  38.98 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.76 
 
 		 262 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  32.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  28.7 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  30.17 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  31.9 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4538  ISSpo6, transposase orf A  31.9 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  32.17 
 
 		 317 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  32.17 
 
 		 317 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3184  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>