64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3184 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3184  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  98.08 
 
 		 283 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  42.22 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  43.53 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  40 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  52.63 
 
 		 315 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  52.63 
 
 		 315 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  40.68 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  40.68 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  41.18 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  42.37 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.05 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  36.05 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  34.83 
 
 		 492 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  36.05 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  40.68 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.23 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  36.05 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  35.23 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  31.63 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  35.23 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  35.23 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  35.23 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  35.23 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  45.16 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  38.2 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  37.36 
 
 		 127 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>