30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2082 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  47.18 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  46.67 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  47.43 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  42.78 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  36.27 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  34.04 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  34.27 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  33.17 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  31.37 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  27.36 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  29.76 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  29.68 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  28.57 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  26.25 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  27.1 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  28.48 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  30.32 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  29.33 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  30.36 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  24.24 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  30.14 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  29.37 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  25.17 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  37.5 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  28.12 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  35.53 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  26.09 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  41.94 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  23.02 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>