106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3963 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.48 
 
 
347 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.28 
 
 
345 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
343 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
343 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.05 
 
 
340 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.05 
 
 
340 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  49.18 
 
 
343 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
362 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
362 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
362 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
362 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
362 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
362 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.18 
 
 
342 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.18 
 
 
342 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.65 
 
 
343 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.65 
 
 
343 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.5 
 
 
343 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
343 aa  158  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 
367 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.55 
 
 
348 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.55 
 
 
348 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  39.15 
 
 
362 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  39.15 
 
 
362 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  39.15 
 
 
362 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  39.15 
 
 
362 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  39.15 
 
 
362 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  39.15 
 
 
362 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 
266 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  45.36 
 
 
307 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  45.36 
 
 
307 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  45.36 
 
 
307 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  45.36 
 
 
344 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  45.36 
 
 
307 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  45.36 
 
 
307 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.72 
 
 
348 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.72 
 
 
348 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.72 
 
 
348 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.72 
 
 
348 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.72 
 
 
360 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.72 
 
 
350 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  44.26 
 
 
363 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  43.17 
 
 
350 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  38.42 
 
 
374 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.46 
 
 
347 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.67 
 
 
340 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.67 
 
 
340 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.67 
 
 
340 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.67 
 
 
340 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  38.5 
 
 
346 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  38.5 
 
 
348 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.5 
 
 
374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.41 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  34.76 
 
 
343 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.26 
 
 
226 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  32.65 
 
 
381 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  38.79 
 
 
185 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  43.75 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  39.33 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3154  hypothetical protein  36.43 
 
 
349 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3153  hypothetical protein  41.94 
 
 
115 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.740304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.61 
 
 
340 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 
343 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3186  hypothetical protein  41.51 
 
 
106 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.271971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  26.54 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1971  hypothetical protein  38.1 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.582599  normal  0.197965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.33 
 
 
338 aa  45.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  29.37 
 
 
341 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  24.11 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  24.11 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  24.11 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  24.11 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.53 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.11 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.82 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  24.82 
 
 
338 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.65 
 
 
348 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.82 
 
 
338 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.82 
 
 
338 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.82 
 
 
338 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 
338 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>