40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0615 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  274  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  37.5 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  38.52 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  37.59 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  35.07 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  36.44 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  38.84 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  37.78 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  36.72 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  31.34 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  34.65 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  33.07 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  30.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  30.88 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  30.6 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  33.6 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  29.37 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  31.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  33.59 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  31.75 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  31.2 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  33.58 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  32.73 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  27.42 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  27.2 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  28.44 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  28.44 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  24.17 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>