53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3249 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  900    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  67.19 
 
 		 458 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  66.89 
 
 		 446 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  68.47 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  69.21 
 
 		 453 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  67.79 
 
 		 452 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  68.47 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  65.91 
 
 		 451 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  62.61 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  63.96 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  64.06 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  57.08 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  56.31 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  55.63 
 
 		 452 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  55.86 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  57.98 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  56.98 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  49.89 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  34.22 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  32.3 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  34.23 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  31.88 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  31.88 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  32.57 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.82 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  30.43 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  30.26 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.31 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  33.8 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 449 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  31.22 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  31.03 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  30.86 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  32.01 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  30.72 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  29.34 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  30.83 
 
 		 424 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  32.02 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  31.06 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  31.07 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  27.67 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  27.67 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  30.25 
 
 		 456 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  29.6 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  22.9 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  26.71 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  25.17 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  25.17 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  23.81 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  23.81 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>