48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2957 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  64.43 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  63.49 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  58.33 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  52.46 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  48.31 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  44.29 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  44.19 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  44.19 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  43.22 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  54.55 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  54.55 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  50.85 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  45 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  37.4 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  42.02 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  40.17 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  37.12 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  42.73 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  35.66 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  36.57 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  40.65 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  36.22 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  32.43 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  37.58 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  35.53 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  41.35 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  34.75 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  34.33 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  35.94 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  30.3 
 
 		 738 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 738 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  33.7 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  43.22 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  33.08 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  40.68 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  40.68 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  40.68 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.4 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  33.7 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.97 
 
 		 752 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.97 
 
 		 730 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  27.74 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  31.29 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.41 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.03 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>