More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1129 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  46.04 
 
 
269 aa  235  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
270 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  38.02 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
273 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.46 
 
 
273 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  33.96 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30.24 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  29.5 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  26.82 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.55 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.29 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.05 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.29 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  36.64 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.21 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  40 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  37.19 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.59 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
711 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.76 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  26.86 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  29.06 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.37 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  27.56 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.45 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
710 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.63 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  34.09 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.81 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.27 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0152496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2496  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  27.9 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  28.19 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.58 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  30.3 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
190 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  35.19 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
624 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  24.73 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  31.47 
 
 
355 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
226 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 
241 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  32.79 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.06 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
240 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.13 
 
 
241 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  31.68 
 
 
387 aa  62.4  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  34.86 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.66 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.55 
 
 
242 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.3 
 
 
235 aa  62.4  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>