More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1076 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.71 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417563  normal  0.341407 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  55.56 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.99 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.4 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.02 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  39.83 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  40.3 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.93 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.73 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  38.58 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.95 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  37.97 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.08 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  41.49 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00204788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  38.15 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  38.15 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  38.15 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  35.66 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 253 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  36.16 
 
 		 253 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 283 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  42.93 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.68 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.66 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.73 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2171  nitrate transport permease  40.22 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  35.69 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  35.69 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  35.69 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  35.69 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  35.69 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  35.25 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  41.58 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  32.82 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  41.85 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  35.32 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  37.19 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.79 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.33 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  34.84 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>