More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6872 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
266 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  63.56 
 
 
257 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  50.59 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  56.82 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  51.6 
 
 
284 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  55.6 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  51.24 
 
 
301 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  49.41 
 
 
272 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  50.87 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  52.19 
 
 
287 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  51.6 
 
 
410 aa  207  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  50.68 
 
 
283 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  50.23 
 
 
410 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  46.75 
 
 
410 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
303 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
298 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.34 
 
 
305 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  32.41 
 
 
309 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
414 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
304 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
229 aa  95.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
227 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
414 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
420 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
476 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
307 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.95 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
314 aa  92  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.7 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  30.56 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  32.54 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
374 aa  89  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
308 aa  88.6  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
386 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
336 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
325 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 
226 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.55 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.74 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  29.02 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
394 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
480 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
346 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
246 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  29.78 
 
 
502 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
327 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.3 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  30 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.54 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.42 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.32 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.62 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.78 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.78 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.78 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.14 
 
 
864 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  30.37 
 
 
874 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  29.03 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
315 aa  79  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.03 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
694 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
217 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>