More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6865 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  57.69 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02447  phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit  31.98 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  34 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 1106 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 885 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.76 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.62 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.01 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.52 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.3 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.92 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 634 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  29.41 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  36.56 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 1032 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.58 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.48 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.04 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.63 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  30.93 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0704  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 170 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0858444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.28 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.28 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.71 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.28 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  26.03 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.81 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  23.37 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  33.06 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.34 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  46.77 
 
 		 706 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  24.72 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  31.13 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.56 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  30.77 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.28 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.61 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  31.43 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>