More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4829 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4829  cytochrome P450  100 
 
 
435 aa  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2099  cytochrome P450  72.04 
 
 
412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554694  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3515  cytochrome P450  51.3 
 
 
404 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8251  P-450 monooxygenase  48.2 
 
 
402 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  34.74 
 
 
415 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4984  cytochrome P450  32.22 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  34.33 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  34.33 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1735  cytochrome P450  31.15 
 
 
401 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1483  cytochrome P450  33.43 
 
 
417 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  32.55 
 
 
409 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  34.01 
 
 
407 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0373  cytochrome P450  33.43 
 
 
409 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1848  cytochrome P450  33.53 
 
 
400 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  31.68 
 
 
419 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  29.85 
 
 
421 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  30.48 
 
 
784 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  30.48 
 
 
784 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  30.48 
 
 
784 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0512  cytochrome P450  31.14 
 
 
398 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  30.48 
 
 
784 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  30.48 
 
 
784 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  30.48 
 
 
784 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  29.3 
 
 
410 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  30.48 
 
 
784 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  31.63 
 
 
396 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  27.18 
 
 
411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  27.18 
 
 
411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  30.99 
 
 
409 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  30.32 
 
 
400 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  26.82 
 
 
411 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  26.93 
 
 
411 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3241  cytochrome P450  32.63 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  30.56 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3303  cytochrome P450  32.63 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0174773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  33.33 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3252  cytochrome P450  32.63 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176211  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  26.57 
 
 
411 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  26.57 
 
 
411 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  34.08 
 
 
403 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  26.68 
 
 
411 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  30.29 
 
 
398 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  34.68 
 
 
398 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  31.28 
 
 
413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.02 
 
 
426 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  26.57 
 
 
411 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  26.57 
 
 
411 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  31.95 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  33.05 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  33.05 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  31.13 
 
 
398 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  29.84 
 
 
402 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0950  cytochrome P450  31.04 
 
 
412 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  33.54 
 
 
404 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  30.51 
 
 
410 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  33.86 
 
 
405 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  29.79 
 
 
399 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.85 
 
 
420 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  30.83 
 
 
399 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  31.58 
 
 
404 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.82 
 
 
401 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  31.63 
 
 
413 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  29.19 
 
 
402 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  28.61 
 
 
782 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  25.69 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  29.41 
 
 
783 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  31.02 
 
 
410 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  29.49 
 
 
402 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  30.41 
 
 
399 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  28.95 
 
 
794 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  33.24 
 
 
398 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  34.06 
 
 
400 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.14 
 
 
412 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.72 
 
 
407 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  32.2 
 
 
414 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.01 
 
 
411 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  26.07 
 
 
411 aa  144  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  30.83 
 
 
420 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  33.98 
 
 
400 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  29.62 
 
 
414 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  31.86 
 
 
418 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  31.86 
 
 
418 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  31.86 
 
 
418 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  30.9 
 
 
403 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  30.66 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  28.92 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  32.59 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  31.81 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  30.12 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  33.91 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  33.96 
 
 
423 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  29.38 
 
 
409 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  28.27 
 
 
780 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  31.15 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  37.62 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  31.1 
 
 
938 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  30.74 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  32.77 
 
 
405 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.95 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  29.79 
 
 
769 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>