More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3112 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 748 aa  1442    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  81.33 
 
 		 749 aa  1123    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 750 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  38.77 
 
 		 436 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  38.24 
 
 		 460 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  39.7 
 
 		 435 aa  247  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 		 446 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 756 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 		 573 aa  207  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 715 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 747 aa  202  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  34.77 
 
 		 715 aa  198  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  27.96 
 
 		 764 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 775 aa  195  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  31.18 
 
 		 421 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 723 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 448 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  31.09 
 
 		 448 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 689 aa  177  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  26.52 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 495 aa  174  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  28.4 
 
 		 816 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.78 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  170  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.42 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  29.03 
 
 		 387 aa  170  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.03 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  29.03 
 
 		 387 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.54 
 
 		 387 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.78 
 
 		 387 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 400 aa  168  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 703 aa  167  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 		 460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 455 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.5 
 
 		 385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 423 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 482 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  27.2 
 
 		 951 aa  158  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 420 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 419 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  32.03 
 
 		 883 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.5 
 
 		 414 aa  152  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 474 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 412 aa  150  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.08 
 
 		 427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.57 
 
 		 375 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.31 
 
 		 442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 406 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 469 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.82 
 
 		 424 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.16 
 
 		 375 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.16 
 
 		 375 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.16 
 
 		 375 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.16 
 
 		 375 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.16 
 
 		 375 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 406 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.91 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 410 aa  146  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  31.68 
 
 		 683 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 422 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.16 
 
 		 375 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 		 473 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 424 aa  142  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 		 413 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 416 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 425 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.43 
 
 		 410 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  32.14 
 
 		 457 aa  138  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 412 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 		 453 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.22 
 
 		 410 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  27.16 
 
 		 375 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.16 
 
 		 375 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  27.16 
 
 		 375 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 410 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 467 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 414 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 467 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 415 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 414 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 397 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 		 429 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 457 aa  134  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.18 
 
 		 386 aa  134  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 		 455 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 404 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.59 
 
 		 399 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 455 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.11 
 
 		 457 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>