94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2711 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2711  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
249 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  61.14 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  35.54 
 
 
247 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
309 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  27.4 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.04 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.1 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4544  hypothetical protein  35.27 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.79 
 
 
305 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  26.84 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.07 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  27.72 
 
 
275 aa  52  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  25.58 
 
 
255 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.33 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  26.46 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  31.15 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  28.79 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.34 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 
307 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.33 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  26.01 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.27 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.24 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  23.79 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.78 
 
 
300 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  26.01 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  26.01 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.63 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  28.76 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  28.63 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  26.48 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  32.76 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  26.01 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  36.78 
 
 
2798 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  36.36 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.38 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  28.65 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  27.32 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  25.37 
 
 
296 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  26.12 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.34 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  26.01 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.34 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  32.23 
 
 
265 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  34.48 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  25.11 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  26.69 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  28.09 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  25.41 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  26.21 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.02 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  26.54 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  24.15 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.12 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  35.82 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.24 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  32.7 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  33.71 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  26.67 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  36.08 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  31.29 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  31.29 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  31.29 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  27.42 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  26.09 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  31 
 
 
119 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.43 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  25.38 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  24.61 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.5 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  25.88 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  33.64 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  28.02 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  27.31 
 
 
307 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  27.85 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  26.09 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  30.91 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  28.27 
 
 
262 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  29.31 
 
 
270 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 
267 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.02 
 
 
320 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>