53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2527 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  100 
 
 		 182 aa  366  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  67.58 
 
 		 184 aa  245  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  49.43 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  47.73 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  45.45 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  45.45 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  46.59 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  46.07 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  45.51 
 
 		 194 aa  168  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  48.86 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  42.13 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  37.85 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  42.22 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  39.31 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  40.46 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  39.33 
 
 		 199 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  39.76 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  43.33 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  39.78 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  40.33 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  40.66 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  36.87 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  40.66 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  40.66 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  40.66 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  40.33 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  37.02 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  39.33 
 
 		 200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  40.33 
 
 		 200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  40.33 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  39.25 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  35.2 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  39.25 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  37.36 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  37.57 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  38.12 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  36.96 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  36.76 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  33.15 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  34.5 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  40.78 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  38.04 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  39.44 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  34.25 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  34.25 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  37.22 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  32.86 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  37.84 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  33.7 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  34.5 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  34.25 
 
 		 221 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>