More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0765 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  255  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2050  response regulator receiver protein  76.38 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000730652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  61.6 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  50.41 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  44.26 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  42.37 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  57.41 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  40.18 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1758 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  37.21 
 
 		 593 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  38.74 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  40 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 2137 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 1987 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  39.82 
 
 		 1888 aa  84.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  39.29 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 237 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  42.74 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6787  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 790 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.39723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  39.64 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 1303 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.29 
 
 		 1992 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  39.83 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  42.06 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 577 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  39.64 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  44.55 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 2022 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 575 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.19 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  36.04 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.19 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.19 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  39.29 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.19 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.19 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  40.38 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  42.06 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.94 
 
 		 1960 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>