26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3216 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  287  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  59.15 
 
 
186 aa  90.1  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  31.96 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  34.29 
 
 
205 aa  50.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  30.86 
 
 
223 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  34.29 
 
 
216 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  34.29 
 
 
217 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  35.71 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  35 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 
216 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  29.27 
 
 
228 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  32.86 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.64 
 
 
194 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  32.39 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  31.43 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.74 
 
 
223 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 
221 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  30 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  28 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  28.09 
 
 
231 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  28.09 
 
 
231 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  31.87 
 
 
740 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  32.73 
 
 
197 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>