More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5224 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  99.4 
 
 		 335 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 335 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 335 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  72.89 
 
 		 344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  59.38 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  53.87 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1052  cobalamin synthesis protein, P47K  90 
 
 		 191 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1051  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  58.12 
 
 		 190 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 344 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  37.12 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  39.19 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35.09 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.19 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  30.5 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  30.03 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.34 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.84 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  25.37 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.06 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  25.23 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  27.27 
 
 		 366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  33.11 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.69 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  25.23 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  27.65 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  28.92 
 
 		 394 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  29.09 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.41 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  29.92 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  30.48 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  26.81 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  34.43 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  28.66 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  39 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  29.48 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  29.76 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  30.65 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.91 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.07 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.77 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.42 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  28.7 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  29.25 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  29.8 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.86 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  25.77 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  38.8 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  29.6 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.04 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  31.96 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  30.86 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  30.81 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  30.81 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.77 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  37.36 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  27.61 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  33.84 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  34.55 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  37.84 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  27.6 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.03 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.41 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.17 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  36.81 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.32 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  30.05 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  33.85 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  25.46 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  31.18 
 
 		 379 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.41 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.3 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.15 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.96 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  30.18 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  29.65 
 
 		 378 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  33.16 
 
 		 460 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  29.65 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  37.3 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  33.33 
 
 		 460 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  34.78 
 
 		 369 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>