More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2891 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
558 aa  1123    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
558 aa  1123    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
558 aa  1123    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  57.55 
 
 
549 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  57.55 
 
 
549 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  58.1 
 
 
550 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  57.38 
 
 
550 aa  591  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  57.89 
 
 
549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 
553 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  43.12 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 
526 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  42.52 
 
 
544 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  39.86 
 
 
540 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  40.51 
 
 
528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
545 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 
548 aa  346  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  38.27 
 
 
549 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
547 aa  344  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  37.79 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  37.79 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  38.88 
 
 
549 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  38.7 
 
 
541 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 
549 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  38.99 
 
 
541 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  40.07 
 
 
550 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 
542 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  37.57 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  37.57 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  38.01 
 
 
539 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 
557 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  37.36 
 
 
540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  36.02 
 
 
548 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  34.79 
 
 
536 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  33.88 
 
 
536 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 
536 aa  289  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  34 
 
 
531 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  34.11 
 
 
531 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
605 aa  228  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 
526 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
526 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 
509 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  52.03 
 
 
218 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 
608 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 
587 aa  150  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 
562 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
522 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  27.85 
 
 
601 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 
515 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 
528 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  28.8 
 
 
561 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  28.43 
 
 
516 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
520 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 
520 aa  143  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 
525 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  26.19 
 
 
560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  28.13 
 
 
564 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 
545 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  25.71 
 
 
545 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 
577 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 
515 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  27.68 
 
 
516 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  25.93 
 
 
544 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 
508 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  27.02 
 
 
560 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
522 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
522 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
506 aa  136  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 
520 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  27.18 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 
549 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 
525 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  27.39 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
551 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 
516 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
584 aa  135  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  27.16 
 
 
560 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  27.01 
 
 
520 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  26.39 
 
 
542 aa  134  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22610  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.14 
 
 
548 aa  134  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  25.5 
 
 
552 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
516 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 
519 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
527 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 
517 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  25.24 
 
 
576 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  26.32 
 
 
560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.2 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  26.23 
 
 
568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  25.09 
 
 
549 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>