More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2666 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2696  AMP-dependent synthetase and ligase  99.63 
 
 		 539 aa  1065    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5429  AMP-dependent synthetase and ligase  68.8 
 
 		 525 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2960  AMP-dependent synthetase and ligase  71.86 
 
 		 513 aa  742    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.958907  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2666  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1067    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3245  AMP-dependent synthetase and ligase  67.33 
 
 		 519 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0034073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2711  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1067    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1981  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 522 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 555 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.51 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.24 
 
 		 549 aa  197  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.57 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.51 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  29.15 
 
 		 549 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.28 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  29.47 
 
 		 552 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.67 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  28.73 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 525 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  28.78 
 
 		 549 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  27.04 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 566 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 520 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.28 
 
 		 552 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 524 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2266  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.84 
 
 		 828 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  28.33 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  28.91 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 		 553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 533 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.19 
 
 		 510 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  28.97 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  26.63 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  27.97 
 
 		 538 aa  171  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  28.86 
 
 		 548 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 536 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 511 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  27.32 
 
 		 576 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 		 554 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.59 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  27.41 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4364  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 500 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 557 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  28.54 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0324  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 510 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  27.89 
 
 		 576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.12 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.42 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 579 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 843 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  25.69 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  26.84 
 
 		 574 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  25.59 
 
 		 578 aa  163  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  26.38 
 
 		 570 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  28.27 
 
 		 562 aa  164  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 517 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  28.76 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  28.6 
 
 		 605 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  24.9 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  28.36 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  27.23 
 
 		 571 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 561 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  25.78 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  27.87 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.41 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 566 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>